關(guān)于正本的第一種說(shuō)法,毀于清乾清宮大火說(shuō)。乾清宮的歷史可以追溯到清順治十二年(公元1655年),康熙八年重修。然而,我們目前所見(jiàn)的乾清宮并不是建成于這個(gè)年代,而是在1797年嘉慶二年之后重建的。重建的原因,正是因?yàn)榧螒c二年發(fā)生的一次大火,將整個(gè)乾清宮幾乎徹底毀滅。那么,《永樂(lè)大典》正本是否象繆荃孫所說(shuō),在當(dāng)時(shí)藏于乾清宮,而且不幸毀于這場(chǎng)大火呢?也有史學(xué)家對(duì)這種說(shuō)法提出了不同意見(jiàn)。乾隆九年至四十年間,清政府曾對(duì)宮中藏書(shū)清理過(guò),所有善本典籍全部集中在一起,編成了《天祿琳瑯書(shū)目》。